Ταυτόχρονα σε παιδιά που παρουσιάζουν την εν λόγω κλινική εικόνα πρέπει να αρχίζει η θεραπεία με αντιϊκά φάρμακα κατά του ιού H1N1 (οσελταμιβίρη, ζαναμιβίρη).

Σε παιδιά που μολύνθηκαν στις Ηνωμένες Πολιτείες από το νέο ιό της γρίπης Α, H1N1 εκδηλώθηκαν σπασμοί και αλλοιώσεις της νευρολογικής τους κατάστασης λόγω του ότι ο ιός προκάλεσε μόλυνση και οίδημα του εγκεφάλου τους. Οι αλλοιώσεις της νευρολογικής τους κατάστασης περιλάμβαναν υπνηλία, αδυναμία, αποπροσανατολισμό και επιβράδυνση των αντιδράσεων τους.

Είναι γνωστό ότι η εποχιακή γρίπη μπορεί να προκαλεί νευρολογικά προβλήματα. Η εποχιακή γρίπη Α και Β είναι δυνατόν να προκαλέσουν μεταξύ άλλων νευρολογικές επιπλοκές όπως σπασμούς, εγκεφαλίτιδα, εγκεφαλοπάθεια, σύνδρομο Reye και άλλες νευρολογικές διαταραχές. 

Υπολογίζεται ότι η εποχιακή γρίπη ευθύνεται για το 5% των οξέων εγκεφαλίτιδων ή εγκεφαλοπαθειών σε παιδιά. Η ιογενής εγκεφαλίτιδα είναι μια πολύ σοβαρή μόλυνση του εγκεφάλου που συνοδεύεται από φλεγμονή και οίδημα.

Ο νέος ιός της γρίπης Α, H1N1 που στην ουσία είναι ένα νέος συνδυασμός που περιέχει γενετικό κώδικα από τη γρίπη των ανθρώπων, τη γρίπων των πτηνών και τη γρίπη των χοίρων, είναι σε θέση να προκαλεί νευρολογικά προβλήματα όπως και η εποχιακή γρίπη. Ωστόσο δεν γνωρίζουμε ακόμη με ποια συχνότητα δημιουργεί νευρολογικά προβλήματα στα παιδιά και το γεγονός αυτό δημιουργεί σοβαρές ανησυχίες.

Μέχρι τώρα βλέπουμε ότι ο ιός H1N1 που έχει προκαλέσει πανδημία φαίνεται ικανός να προσβάλλει υγιή παιδιά μεγαλύτερης ηλικίας και νέους ενήλικες. Η σοβαρότητα των νευρολογικών προβλημάτων που προκάλεσε η νέα γρίπη Α, Η1Ν1 στα 4 παιδιά στις Ηνωμένες Πολιτείες ήταν λιγότερο σοβαρές από ότι περιγράφεται για την εποχιακή γρίπη.

Οι γιατροί και οι γονείς πρέπει να ενήμεροι ότι η εποχιακή αλλά και η νέα γρίπη Η1Ν1 μπορούν να προκαλούν νευρολογικές διαταραχές και εγκεφαλίτιδα με κίνδυνο για τη ζωή του παιδιού ή σοβαρά κατάλοιπα. Σε παιδιά που έχουν σημεία και συμπτώματα ανάλογα με αυτά της γρίπης που έχουν και σπασμούς ή αλλοιώσεις του επιπέδου συνείδησης, η διαφορική διάγνωση πρέπει να περιλαμβάνει μεταξύ άλλων και τη διάγνωση της εποχιακής γρίπης, της νέας γρίπης και του συνδρόμου του Rey.     

Σε παιδιά που εισάγονται σε νοσοκομείο με συμπτώματα γρίπης ή άλλης ιογενούς μόλυνσης δεν πρέπει να χορηγούνται ασπιρίνη ή άλλα φάρμακα που περιέχουν ασπιρίνη. Η ασπιρίνη μπορεί να προκαλεί το σύνδρομο Reye σε παιδιά.

Το σύνδρομο Reye μπορεί να προσβάλει όλα τα όργανα του σώματος του παιδιού ή του έφηβου αλλά επηρεάζει σοβαρότερα το συκώτι και τον εγκέφαλο. Πρόκειται για σοβαρή μορφής επιπλοκή με γρήγορη εξέλιξη νευρολογικών διαταραχών, λήθαργου, σύγχυσης, σπασμών και κώματος που απειλεί τη ζωή του ασθενούς.

Παρά το γεγονός ότι δεν υπάρχει ακόμη εμβόλιο κατά του νέου ιού της γρίπης Α, H1N1 συστήνεται σε όλα τα παιδιά άνω των 6 μηνών να εμβολιάζονται ετησίως με το εμβόλιο της εποχιακής γρίπης για την πρόληψη της ασθένειας και των επιπλοκών που προκαλούνται από την εποχιακή γρίπη.