Υπάρχουν υποψίες ότι το χλώριο που προστίθεται στο πόσιμο νερό για την εξουδετέρωση παθογόνων μικροβίων, είναι δυνατόν να δημιουργεί χημικές ενώσεις βλαβερές για την ανθρώπινη υγεία. 

Τα παράγωγα του χλωρίου που δημιουργούνται στο πόσιμο νερό και προκαλούν ανησυχία, είναι τα τριαλομεθάνια και αλο-ακετικά οξέα. Είναι το αποτέλεσμα αντιδράσεων μεταξύ του χλωρίου και οργανικών ουσιών που υπάρχουν κανονικά στο νερό. Τα χλωριωμένα οργανικά παράγωγα δεν έχουν μυρωδιά ή γεύση και σε ψηλές συγκεντρώσεις μπορεί να επηρεάζουν την υγεία.

Διερευνάται κατά πόσο οι εν λόγω ουσίες αυξάνουν τον κίνδυνο προσβολής των καταναλωτών του χλωριωμένου πόσιμου νερού από καρκίνους της ουροδόχου κύστης, του ήπατος και των νεφρών.

Γίνονται συνεχώς προσπάθειες για την ανεύρεση αποτελεσματικών, πρακτικών και οικονομικών μεθόδων για την εξουδετέρωση των οργανικών ενώσεων του χλωρίου που είναι ύποπτες για την πρόκληση βλαβών στον άνθρωπο.

Πρόσφατα Καναδοί ερευνητές από το πανεπιστήμιο Laval της πόλης του Κεμπέκ, εξέτασαν 3 συνήθεις μεθόδους που χρησιμοποιούνται για την κάθαρση του χλωριωμένου νερού από οργανικές νοσογόνους ενώσεις που βελτιώνουν παράλληλα τη γεύση, οσμή και εμφάνιση του νερού.

Οι μέθοδοι αυτές ήταν η αποθήκευση του νερού στο ψυγείο, ο βρασμός μέχρι κοχλασμού του νερού πριν από την αποθήκευση στο ψυγείο και το φίλτρο ενεργού άνθρακα ακολουθούμενο από αποθήκευση στο ψυγείο.

Τα αποτελέσματα μετά από 48 ώρες έδειξαν τα ακόλουθα για τις 3 μεθόδους επεξεργασίας του πόσιμου νερού: Η αποθήκευση του χλωριωμένου νερού στο ψυγείο για 48 ώρες μείωνε τα τριαλομεθάνια κατά 30%   Το βράσιμο του νερού μέχρι σημείου κοχλασμού πριν από την αποθήκευση μείωνε τα τριαλομεθάνια μέχρι 87%   Η χρήση φίλτρου ενεργού άνθρακα μείωνε κατά 92% τα τριαλομεθάνια πριν από την αποθήκευση του νερού   Η άμεση αποθήκευση του νερού και ο κοχλασμός του δεν επηρέαζαν τη συγκέντρωση των αλο-ακετικών οξέων. Το φίλτρο ενεργού άνθρακα βρέθηκε να μειώνει τη συγκέντρωση των οξέων αυτών κατά 66%

Τα φίλτρα ενεργού άνθρακα φάνηκαν περισσότερο αποτελεσματικά στο να μειώνουν σημαντικά τις βλαβερές οργανικές χλωριωμένες ενώσεις του πόσιμου νερού σε σύγκριση με τις άλλες μεθόδους.  

Επισημαίνεται ότι στις πόλεις όπου γίνεται ορθός χειρισμός και παρακολούθηση των πόσιμων υδάτων και τηρούνται τα συστηνόμενα επίπεδα για τη συγκέντρωση των ουσιών αυτών, δεν χρειάζεται επιπρόσθετη επεξεργασία στο σπίτι.

Σε περιοχές όμως όπου υπάρχουν ψηλές συγκεντρώσεις χλωριωμένων οργανικών παραγώγων, οι μέθοδοι επεξεργασίας του χλωριωμένου πόσιμου νερού στο σπίτι αποκτούν ιδιαίτερη σημασία.

Είναι σημαντικό να υπάρχει παρακολούθηση της τήρησης των οδηγιών σχετικά τα συστηνόμενα επίπεδα δυνητικά επικίνδυνων ουσιών. Σε ορισμένες χώρες όπως στον Καναδά, τα εν λόγω επίπεδα ασφάλειας καθορίζονται και επιβάλλονται δια νόμου.

Ο πληθυσμός πρέπει να διαφωτίζεται και να ενημερώνεται για τα ζητήματα που αφορούν το πόσιμο νερό. Επίσης να γίνεται γνωστό ότι τα φίλτρα πρέπει να αλλάζονται τακτικά σύμφωνα με τις οδηγίες του κατασκευαστή τους.